此前媒体曾报道，新机场线设站5座。市人大代表、北京市轨道交通建设管理有限公司董事长吴宏建今天上午接受记者采访时表示，目前来看站点设置将不止5座。“为了疏解沿线周边地区交通，如果站点设置过少会形成堵点。”吴宏建表示，虽然线路较长，但是运营时间是有保障的，未来有望采取“大小交路”、“大站快车”等形式保证运行时间。
新机场线将综合考虑快捷式和服务更大区域两个功能结合，让新机场成为引领北京地区发展的一个交通枢纽。目前，北京市政府正在组织有关部门和专家进行论证，要将这条线建成一条总结借鉴世界各地轨道交通发展，并且服务机场的线路。
新机场线确定经过10号线的草桥站、4号线的北京南站以及10号线北部北三环地区的牡丹园站，线路在城区中不会是一条南北向的直线，而将连接多个重要交通节点。