6月12日10时，海南省海洋预报台发布海浪橙色（二级）预警。受台风“蝴蝶”影响，预计当天中午到次日中午，海南岛以南、西沙附近海面将出现4.0～6.0米的巨到狂浪；雷州半岛以东、北部湾南部、海南岛以东、南沙北部海面有4.0～5.0米的巨浪；北部湾北部、琼州海峡海面则会有3.0～4.0米的大到巨浪。此外，东沙附近、中沙附近、南沙以南到曾母暗沙附近海面会出现2.5～3.5米的大浪。文昌市、琼海市、万宁市、陵水黎族自治县、三亚市近岸海域将出现3.5～4.8米的大到巨浪，预警级别为橙色。海口市、澄迈县、临高县、昌江黎族自治县、东方市、乐东黎族自治县近岸海域将出现2.0～3.2米的中到大浪，预警级别为蓝色。相关海域作业船只需提前做好防浪避浪工作，并关注后续预报。
同日，海南省海洋预报台根据《海南省海洋灾害应急预案》发布风暴潮IV级警报（蓝色）。受台风“蝴蝶”影响，预计6月12日上午至13日上午，海南岛沿海将出现30到70厘米的风暴增水，海口市、文昌市、琼海市和三亚市的风暴潮预警级别为蓝色。请有关单位做好防潮准备，并密切关注后续预报。
6月12日11时，海南省水务厅与气象局联合发布蓝色山洪灾害气象风险预警。预计从当天11时至次日8时，三亚市、万宁市、五指山市、乐东黎族自治县、陵水黎族自治县、琼中黎族苗族自治县、白沙黎族自治县及保亭黎族苗族自治县等市县的部分地区可能发生山洪灾害，达到蓝色预警级别。其他地区也需警惕因局地短历时强降水引发的山洪灾害，相关部门应做好监测预警及转移避险等防御工作。
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